Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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