Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc159Q8C963 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms