Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Usp20Q8C6M1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Usp20Q8C6M1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Usp20Q8C6M1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Usp20Q8C6M1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Usp20Q8C6M1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Usp20Q8C6M1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Usp20Q8C6M1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Usp20Q8C6M1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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