Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sfrp1Q8C4U3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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