Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms