Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPC6

Probable isocitrate dehydrogenase [NAD] gamma 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BPC6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BPC6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BPC6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BPC6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms