Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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