Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ubash3bQ8BGG7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ubash3bQ8BGG7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ubash3bQ8BGG7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ubash3bQ8BGG7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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