Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms