Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms