Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rpp38Q80UU2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rpp38Q80UU2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rpp38Q80UU2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rpp38Q80UU2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rpp38Q80UU2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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