Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

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Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Usp8Q80U87 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp8Q80U87 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp8Q80U87 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp8Q80U87 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp8Q80U87 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp8Q80U87 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp8Q80U87 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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