Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms