Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms