Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmed3Q78IS1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms