Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1cQ76I25 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms