Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms