Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcl3Q6W5C0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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