Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl2Q6PA06 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms