Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtminQ6P9S1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms