Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sp140Q6NSQ5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sp140Q6NSQ5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sp140Q6NSQ5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sp140Q6NSQ5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms