Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mvb12bQ6KAU4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms