Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Sh3rf1Q69ZI1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Sh3rf1Q69ZI1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Sh3rf1Q69ZI1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Sh3rf1Q69ZI1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Sh3rf1Q69ZI1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Sh3rf1Q69ZI1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Sh3rf1Q69ZI1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sh3rf1Q69ZI1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sh3rf1Q69ZI1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sh3rf1Q69ZI1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sh3rf1Q69ZI1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sh3rf1Q69ZI1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sh3rf1Q69ZI1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sh3rf1Q69ZI1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sh3rf1Q69ZI1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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