Protein–RNA interactions for Protein: Q64092

Tfe3, Transcription factor E3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tfe3Q64092 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Tfe3Q64092 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Tfe3Q64092 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Tfe3Q64092 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfe3Q64092 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Tfe3Q64092 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms