Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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SnrpaQ62189 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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