Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RhocQ62159 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RhocQ62159 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RhocQ62159 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RhocQ62159 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RhocQ62159 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RhocQ62159 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RhocQ62159 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RhocQ62159 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RhocQ62159 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RhocQ62159 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RhocQ62159 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RhocQ62159 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RhocQ62159 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RhocQ62159 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RhocQ62159 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RhocQ62159 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RhocQ62159 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RhocQ62159 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RhocQ62159 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RhocQ62159 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RhocQ62159 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
RhocQ62159 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhocQ62159 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RhocQ62159 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RhocQ62159 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhocQ62159 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms