Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms