Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Epha1Q60750 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epha1Q60750 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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