Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms