Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CttnQ60598 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CttnQ60598 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CttnQ60598 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CttnQ60598 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms