Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFZ0

UPF0711 protein C18orf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5XFZ0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q5XFZ0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms