Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms