Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX79

Shroom1, Protein Shroom1, mousemouse

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Length 823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom1Q5SX79 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Shroom1Q5SX79 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Shroom1Q5SX79 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Shroom1Q5SX79 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Shroom1Q5SX79 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Shroom1Q5SX79 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Shroom1Q5SX79 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Shroom1Q5SX79 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Shroom1Q5SX79 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shroom1Q5SX79 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Shroom1Q5SX79 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Shroom1Q5SX79 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shroom1Q5SX79 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shroom1Q5SX79 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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