Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms