Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp18Q5SSI6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms