Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf2Q59J78 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms