Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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