Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms