Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms