Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Carmil2Q3V3V9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Carmil2Q3V3V9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms