Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933416C03RikQ3V063 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
4933416C03RikQ3V063 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933416C03RikQ3V063 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933416C03RikQ3V063 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933416C03RikQ3V063 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933416C03RikQ3V063 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
4933416C03RikQ3V063 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933416C03RikQ3V063 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
4933416C03RikQ3V063 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933416C03RikQ3V063 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933416C03RikQ3V063 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
4933416C03RikQ3V063 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933416C03RikQ3V063 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933416C03RikQ3V063 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933416C03RikQ3V063 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933416C03RikQ3V063 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933416C03RikQ3V063 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933416C03RikQ3V063 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
4933416C03RikQ3V063 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
4933416C03RikQ3V063 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
4933416C03RikQ3V063 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933416C03RikQ3V063 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms