Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms