Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQN2

Fcho2, F-BAR domain only protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho2Q3UQN2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Fcho2Q3UQN2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcho2Q3UQN2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms