Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms