Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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