Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cog7Q3UM29 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cog7Q3UM29 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms