Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKK2

Ceacam5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam5Q3UKK2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ceacam5Q3UKK2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms