Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Arfgef3Q3UGY8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Arfgef3Q3UGY8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Arfgef3Q3UGY8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Arfgef3Q3UGY8 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Arfgef3Q3UGY8 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Arfgef3Q3UGY8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Arfgef3Q3UGY8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms