Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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