Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms